Wednesday, June 29, 2016

[solved]smoke detector beeps every 10s or so.

It's because the battery is low.

1. replace all the batteries
2. push reset/test
3. It will beep a triplet sound and after a while you are all set

Tuesday, June 28, 2016

ENCODE namecard Shirley Xiaole Liu 刘小乐

姓        名
 刘小乐
 学        位
 博士
导师情况
博士生导师
研究方向
计算基因组学,转录调控和表观遗传组学
E-mail
通讯地址
上海市四平路1239号,同济大学生命科学与技术学院(200092)
个人简介:刘小乐 (Xiaole Shirley Liu) 青年时代就读于天津南开中学, 1992 年考入北京大学生物系。 1994 年转学到美国史密斯女子学院 (Smith College) 双修生物化学和计算机科学, 三年后以最高拉丁荣誉毕业 (Summa Cum Laude, 授予全校积分最高的 1% 的毕业生)。2002 年于斯坦福大学取得生物医学信息学博士和计算机科学辅修博士学位后, 被直接聘为哈佛大学终身制助理教授。她目前担任哈佛大学公共卫生学院生物统计与计算生物学系的终身正教授、Dana-Farber 肿瘤研究所功能性癌症表观遗传组学中心主任和同济大学生物信息学系教授并长江学者讲座教授。

研究领域:
    刘小乐的工作侧重于基因调控机制的生物信息和计算生物学研究。她的科研组通过整合全基因组 ChIP-chip/Seq, 核小体定位, 组蛋白修饰, 基因表达谱, 基因组序列等数据, 构建转录与表观遗传调控的计算和统计模型。她的主要科学成就可以归纳成为四个方面:

    首先,她开发了一些被广泛应用和引用的算法寻找转录因子基序 (transcription factor motif discovery)。这些算法, 比如BioProspector, MDscan, Motif Regressor, CompareProspector, AdaBoost (引用加全超过 1,400 次), 成为以后出版 motif discovery 的算法发现改善的标杆。

    其次,她是ChIP-chip/seq数据分析的先驱。她和同事们发表了ChIP-chip领域内的第三篇文献 (Lieb et al, Nat Genet 2001, 引用441次), 和历史上第一个人类全基因组增强子的功能 (Carroll et al, Nat Genet 2006, 引用374次)。她开发出十分受欢迎的ChIP-chip (MAT 和 MA2C, 有 22 篇发表在 Nature/ Science/ Cell 系列上的论文使用了刘小乐组开发的 MAT 算法来分析 ChIP-chip 数据)与ChIP-seq分析算法(MACS, 超过 1,600 个注册用户), 以及下游的分析流水线(CEAS, 引用40次)。她组里正在研发一套 ChIP-chip/seq 系统研究的计算平台 (http://cistrome.org/)。

    她第三方面的成就在于表观遗传调控。她与同事们发表了第一个高通量人类核小体分布图谱 (Oszolak et al, Nat Biotech 2007, 引用126次), 比较核小体本质性定位与活体定位的不同(Zhang et al, Nat Struct Mol Biol 2009, 引用32次), 发现H3K36me3在基因组的定位特性(Kolasinska-Zwierz et al, Nat Genet 2009, 引用47次)。 最近, 他们又发现斑马鱼胚胎干细胞中组蛋白修饰起始特性 (Vastenhouw et al, Nat 2010), 并运用组蛋白修饰动态变化揭示基因转录调控机理 (He et al, Nat Genet 2010)。

    最后,她在对癌症以及代谢疾病的核受体调控的认识中做出了重要贡献。通过全基因组ChIP-chip / seq 数据分析,她和同事们发现了乳腺癌中的雌激素受体(ER, Carroll et al, Cell 2005; Carroll et al, Nat Genet 2006, 共同通讯作者),前列腺癌中的雄激素受体(AR, Wang et al, Cell 2009, 共同通讯作者),乳腺癌与前列腺癌中ER和AR的协同作用转录因子与染色质异构子 (FoxA1, Lupien et al, Cell 2008),糖尿病中氧化物酶体增殖物激活受体 (PPAR,Lefterova et al, Genes Dev 2008) 等的重要的转录与表观调控机制。


成果与获奖:
    刘小乐发表了 70 篇文献 (26 篇是(共同)第一或通讯作者), 包括 19 篇在 Nature/Cell 系列中 (其中 7 篇是(共同)第一或通讯作者)。根据 Google Scholar 统计她的 H-index 为 28,就是说她有 28 篇论文被引用超过 28 次。 她做过 26 场国际会议特邀学术报告, 在世界各地的大学与研究机构举行过 50 次讲座和研讨会。她担任 19 家期刊 (包括 Nature, Nature Genetics, Nature Review Genetics, 和Nature Biotechnology) 和 3 个国际会议的审稿人, 并且先后担任 Genomics, Annals of Applied Statistics, Biostatistics, 和 BMC Bioinformatics 的编委。她还参与了 9 个美国国内或国际科学会议的组织和程序委员会。
    刘小乐非常关心教书育人。在最近 5 年里, 她在不同的学术机构教授了 8 门不同的课程和讲习班, 包括在哈佛大学的 3 门课程以及 2007 年国家自然科学基金的龙星计划课程。她在哈佛的研究小组的学生、程序员、分析师、博士后、研究员来自不同背景(4 名物理,2 名生物物理,以及化学工程、电气工程、生物、生物信息、计算机和经济学各一名) ,并且她在同济大学现有三名研究生。她不仅仅是实验室成员科学研究方面的导师,还关注他们的事业发展前途。她组里的博士毕业生和博士后大都在优秀高校终身制任教 (加州大学旧金山分校, 贝勒医学院, 亚利桑那大学, 杨百翰大学, 同济大学)。
    刘小乐 2002 年成为高等教育年鉴 (The Chronicle of Higher Education) 的封面人物, 获得了Bioinformatics Whiz 和 rising star 的美誉。她 2005 年获得 Claudia Adams Barr 创新基础癌症研究奖, 2006 年获得国防部前列腺癌研究计划新人奖,  2008 年获得 Sloan 基金会研究奖金。她目前担任三项美国卫生部 (NIH) 资金和一项国防部资金的 PI (Principle Investigator), 以及六项 NIH 资金的骨干 (Co-Investigator)。她还担任美国卫生部, 自然科学基金, 和国防部医学研究计划的评审团委员。

未来展望
    生物医学研究的未来不仅依赖于可以设计出优秀实验并产生高质量数据的实验生物学家,还要依赖于会对产生的数据进行有效分析挖掘的计算生物学家。公共域的基因组数据比任何一个实验室能产生的数据都多,而且有更多的知识含量。配备了广泛的生物学知识、充足的数据挖掘及算法开发技能,计算生物学家能够有效地利用公共数据,从更多的相关数据中更快地找到规律, 设计出更好的生物学实验,为生物医学的新发现做出重要贡献。 随着高通量测序技术的不断提高, 数据生成将会象超市购物一样容易和充足,而且基础科学 (用模式生物和细胞株) 研究、转化医学 (用正常和得病人的组织器官) 研究、和临床 (直接接触病人) 研究之间的距离将会缩短。在 5 年之内, 用不到 $100 在一小时内测序一个人体基因组将会成为现实。生物医学研究者的方向、模式和所提出的问题将会和现在完全不同。 每个生物医学研究工作者都应该问自己:我怎样为这一天做好准备?刘小乐期待着与有志向、有天分的同学们一起探索生物医学的奥妙。

ENCODE namecard --- Zhiping Weng 翁志萍 (Chinese version)

http://school.freekaoyan.com/sh/tongji/daoshi/20130131/1359562851125166.shtml

姓名:翁志萍
学位:博士
导师情况:博士生导师
研究领域:生物信息学
研究方向:1、基因组学和表观遗传学
2、SmallsilencingRNAs
3、蛋白质之间的相互联系
E-mail:Zhiping.weng@umassmed.edu
联系电话:
通讯地址:上海市四平路1239号,同济大学生命科学与技术学院(200092)

个人简介:
翁志萍博士于1987年考入中国科技大学就读,1993年赴美国波士顿大学深造,与1997获得生物医学工程博士学位,2007年末至今担任马萨诸塞州大学医学院终身教授并生物信息系主任,建立并主持新的生物信息学项目。翁志萍博士于2012年被评为国家千人计划重点学科讲座教授。她能够在短时间内就能够在麻省医学院所建立这样一个活跃的研究团队以及她创立的出色的生物信息学及整合生物学项目,证明翁教授是一位有着非凡才能并且拥有出色的科学、教育及领导才能的科学家。
翁志萍博士曾帮助DeLisi教授建立全新的生物信息研究项目(波士顿大学的CharlesDeLisi教授是世界范围内基因组学与生物信息学的学科带头人,曾被美国前总统克林顿授予著名的公民奖章),这也是全世界最早的授予生物信息学博士学位的项目之一。翁志萍博士在2003年,她毕业六年以后,获聘终身副教授。她由博士毕业到成为终身副教授所花费的时间要远远少于平均值。当时,她也以32岁的年龄成为波士顿大学历史上最年轻的具有终身职称的教授之一。翁教授在很多领域,包括结构生物信息学,基因组学,表观基因组学及小sRNA,都做出了非常卓越的科研工作。她已经发表了超过100篇同行评议的论文。她已经获得了30多个科研奖励,为自己实验室筹集总共超过1200万美元的科研经费。目前有总共20余个研究生和博士后毕业于她的项目,大部分甚至已经在获得博士学位之前进入了生物技术工业领域。
研究领域(具体内容):
1.基因组学和表观遗传组学
翁志萍博士和研究团队为理解基因调控的遗传和表观遗传的机制开发了计算方法。他们还开发了新方法来发现基因组的DNA上的转录因子结合位点。并寻求多种方法,包括用概率模型和基因识别检测转录因子结合位点的集群,以一起调解并取启动子中序列模体的富集的优势。他们运用大量的高通量遗传和表观遗传的数据得到一个综合方法如转录因子的染色质免疫共沉、核小体定位、组蛋白修饰、DNA甲基化和DNA复制。最新的工作包括了基因组学、表观遗传组学的个人化并使其应用于诊断和治疗肌肉萎缩性侧索硬化症、亨廷顿氏病、自闭症和精神分裂症。
2.起沉默作用的小RNA(SmallsilencingRNAs)
翁博士及研究团队开发了算法用来研究生源论和起沉默作用的小RNA(microRNAs或miRNAs、smallsilencingRNAs或siRNAs、PIWI-interactingRNAs或piRNAs)的调控机制。建立了计算管道来分析起沉默作用的小RNA析高通量测序数据。他们绘制了数百万的基因组读出序列,确定了它们的长度和和核苷酸性质、基因组定位、不同细胞类型和/或基因型的相对丰度、进化守恒,并发现一些其他可以揭示起沉默作用的小RNA的生物遗传和靶识别的特征。
3.蛋白质之间的相互联系
翁博士和团队还开发了计算蛋白质分子之间的结合亲和度的方法。融合这个方法和快速傅立叶变换算法,开发出预测复杂蛋白质结构的计算方法。采用多级途径,例如,开发了在转译和旋转区域执行详尽搜寻的第一级算法ZDOCK,随后细化得到算法,如用于结构完善和重排序的ZRANK。他们参与了全社会范围蛋白质对接算法CAPRL的盲测。并把一组对接算法进行了注册,授权于Accelrys有限公司出售给商业用户,对于学术和政府用户是免费的。

专业业绩(承担项目、发表论文、教学成果):
一、获得的重要奖项:
1.美国国家科学基金会(NSF):ProfessionalOpportunitiesforWomen(POWRE)Award
2.美国国家科学基金会(NSF):CAREERAward
二、国际学术组织兼职:
至今美国国家科学基金会(NSF)专家组成员
至今美国国立卫生研究院(NIH)专家组成员
至今霍华德休斯医学研究所基金(HHMIfellowship)专家组成员
2005-2006人类基因组计划(ENCODE)联合体转录调控分析组(theTranscriptionalRegulationAnalysisgroup,theENCODEconsortium)联席主席Co-chair
2005-至今BMCBioinformatics编委会成员(Editorialboardmember)
2007-至今NCBI科学顾问委员会成员(NCBIBoardofScientificCounselors)
2010伍斯特理工学院数学科学院年度科学展览会评审(theMassAcademyofMath&SciencesAnnualScienceFairatWorcesterPolytechnicInstitute)
2010CharlesA.King诚信博士后奖学金项目(CharlesA.KingTrustPostdoctoralFellowshipProgram)专业审稿人(ScientificReviewer)
TheoreticBiology,JournalofMolecularBiology,Bioinformatics,Proteins,ProteinScience,JournalofImmunology,HumanImmunology,GenomeResearch,NucleicAcidsResearch,BMCBioinformatics,PLoSBiology,PLoSGenetics,PLoSComputationalBiology,PNAS14本期刊常务审稿人(Regularreviewer)
三、国际学术会议做的重要报告:
在数十次国际会议上做过重要报告,发表书刊章节、应邀文章、国际会议论文和研究报告近20篇。在国际会议所作的重要报告和应邀学术交流报告,超过100次。
四、培养学生和指导博士后情况:
已毕业的博士研究生20名,已毕业的硕士研究生4名,指导过的已出站博士后3名,指导在职的博士后7名,还对若干访问学者进行过指导。并教授过11门课程。

Sunday, June 26, 2016

[solved] how to delete a facebook page you created

1. log on to facebook and go to your page you want to delete
2. click "publishing tools" on top right
3. click "settings" on top right corner
4. You will find the "remove page" on the bottom of the "general panel", click in and follow instructions